Здравствуйте!
Как известно упращенцы не платят НДС.
Я - ИП - посредник, между поставщиком и покупателями.
Покупаю у поставщика, оплачивая его счета с НДС.
Продаю покупателям, выставляя счета без НДС.
====
В соответствии с подп. 8 п. 1 ст. 346.16 НК РФ суммы НДС, которые были Вам предъявлены контрагентом и Вы их оплатили, Вы учитываете в составе расходов.
Какие действия я должен выполнять для того чтобы НДС со сделки (закупка у поставщика - продажа клиенту) отражалась в КУДиР отдельной строкой?

В случае учета иных не материальных расходов (оплата рекламы, канцелярии, интернета и т.д.) - в КУДиР могу указывать - отдельной строй или нет включать.

Сф полученный ввёл?

Мы получаем УПД от поставщика.
Галочку с/ф в поступлении ставим.
В журнале с/ф полученные: автоматом создаются.

В с/ф:

В реквизите "НДС возмещается" следует указать "Да", если НДС
подлежит возмещению из бюджета, или "Нет", если НДС подлежит
включению в материальные расходы.
==
У нас проставляется "Нет".

В доке поступлении мат ресурсов:

"По операциям, облагаемым НДС".

Если флажок установлен, то НДС, уплаченный поставщику при
покупке материальных ресурсов, не включается в стоимость приобретенных ресурсов.

Если флажок снят, то приобретенные материальные ресурсы учитываются по стоимости,
включающей НДС.
===
Здесь мы снимаем всегда галку с "По операциям, облагаемым НДС"