Выяснилось следующее.
а) 1с в платформе, похоже, слегка сломала поиск по строке (в динамическом списке с произвольным запросом и определенными условиями по запросу). В старой версии установлен режим совместимости 8.3.7, в той же обработке все работает. Новая версия требует не ниже 8.3.8, но на нем, на 8.3.9 и без режима совместимости поиск по строке валится с ошибкой.
б) Вызывает этот глюк запрос, где ссылочные поля засунуты в агрегатные функции (минимум/максимум). Вытащил из агрегатных функций - все починилось.