(2) Никакие. Надо еще смотреть номер релиза, в каком-то из весенних релизов они снесли весь функционал по отложенному вычету НДС по ОС, вместе с регистрами накопления, и начиная с него все должно приниматься к вычету.
PS:
Новое в версии 1.3.87
УЧЕТ НДС
Минфин РФ в письме от 18 ноября 2016 г. N 03-07-11/67999 разрешил принимать к вычету налог на добавленную стоимость при приобретении основных средств после их отражения на счете 08 "Вложения во внеоборотные активы".
Документ "Формирование записей книги покупок"
При автоматическом заполнении документа "Формирование записей книги покупок" в табличной части отражаются суммы НДС по основным средствам, принятым к учету на счет 08.04 "Приобретение объектов основных средств".
А вот если надо пересчитать на свежем релизе книгу покупок за 2016 г., чтобы принялось только после ввода в эксплуатацию - я не знаю, как я понимаю теперь только руками.
Основная теорема систематики: Новые системы плодят новые проблемы.