Сделал форму выбора для справочника, сделал событие для поля ввода.
В отладчике виду что у отбора есть значение, Использовать = истина, но отбор не срабатывает.
    Если Элемент.Значение = "" Тогда
        СправочникСписок.Отбор.Наименование.Использование = Ложь;
    Иначе
        СправочникСписок.Отбор.Наименование.ВидСравнения = ВидСравнения.Содержит;
        СправочникСписок.Отбор.Наименование.Значение = элемент.значение;
        СправочникСписок.Отбор.Наименование.Использование = Истина;

    КонецЕсли;    

Скриншот с таблом отладчика:
[url=http://savepic.ru/14561414.htm][img]http://savepic.ru/14561414m.png[/img][/url]

Всю процедурину покажи

(1) Дело было в имени табличного поля. Копировал с другой формы и вместо Список было Список1.
Про#бал, в общем.