Добрый день,
после загрузки ЗИК в ЗУП, обособленные подразделения выгрузились в справочник Организаций, нужно чтобы подразделения ЗиК были в структуре организации в ЗУП перенеслись в справочник Подразделения организаций.

чтобы не перезагружать заново (пользуясь алгоритмом ниже), как исправить все корректно в программе ?

Вот основной комментарий по загрузке.

Подразделения, находящиеся на выделенном балансе в ЗУП считаются Организациями. Все обособленные подразделения ЗиК с заполненным реквизитом КПП будут перенесены в справочник Организации конфигурации ЗУП. По ним будет формироваться отдельная регламентированная отчетность. Если нужно чтобы подразделения ЗиК в структуре организации в ЗУП перенеслись в справочник Подразделения организаций, очистим в справочнике Подразделения реквизит КПП и уберем флажок Обособленное подразделение с выделенным балансом;


Подробнее: https://buh.ru/articles/documents/14882/

"перезагружать заново" тяжко? операция занимает неделю времени на сервере?
ну тогда берем менялку ссылок и каждую ссылку на отдельную оргу меняем на подразделение в основной орге. это ж все равно наполнение чистой БД, так что ничего не посыплется. чтобы не ругалось на еще не записанные изменения Обмен=Истина.