Надо формировать файл *.rep, допустим за 22-е, хотя сегодня 25-е.

Почитать инструкцию - вывалить ему команду и подождать.
На сайте АТОЛ-а, кстати, всё есть.

войти в режим «Супервизор» в меню «Сервис» и выбрать пункт «Выгрузка данных».

и не забыть закрыть смену

"Надо формировать файл *.rep"
не надо нам тут свои форматы навязывать

в файл флаге
$$$TRANSACTIONSBYDATERANGE
22.08.2017;22.08.2017