После заведения пользователей (у всех роль полные права) или после поднятия релиза из формы заказа покупателя из подменю ввод на основании пропал новый добавленный документ.

Права на этот документ есть. Как его вновь добавить? В разделе ввод на основании в конфигураторе, он тоже есть

там в новой БСП со многими кнопками беда, ищи в модуле где собираются документы по основанию

для кнопки печать массив объектов метаданных собирается не перебором оных, а грубо добавлением каждого известного разработчику объекта и соответственно все добавленные объекты идут по боку, предполагаю что в данном случае такое же гениальное решение

(0) А документ добавлялся внешней обработкой или изменением в конфигуратора?