Добрый день.

Как перенести всплывающее окно, которое появляется справа в углу при проведении документа на управляемых формах, например (Проведение документа №....)?

никак

Такой вариант ответа я уже знал. Думал может есть другой ))

смотри мою тему, никак

Убрать всплывающие окна при проведении документа

можно убрать Отключения уведомления в 8.3.10