Иногда возникают такие ситуации, что не все обработчики корректно обрабатываются.
Нашел решение тут на форуме. Борльше этот пост для себя.

Делаем как всегда копию базы и на ней эксперементируем.

"Если же нужно перезапустить все обработчики инициируешь обновление заново таким дедовским способом (работает с 11.1.5 и выше):

1. Открываешь РС "Версии подсистем" и в строке "УправлениеТорговлей" устанавливаешь версию, с которой нужно "пере-обновиться".

2. Перезапускаешься. Сначала запускаются обработчики обязательные для выполнения, затем - отложенные.

Если нужно перезапустить именно отложенные обработчики, тогда в том же РС, НЕ меняешь версию подсистемы УТ, но снимаешь галку "Выполнены регистрация отложенных обработчиков" и в п.2.

По отложенным обработчикам, я бы рекомендовал тебе найти то место, где они все описаны и просто ремаришь их все, кроме того, на котором первый раз ошибается. И затем, из того, что я описал тебе выше - быстро перезапускаешь сам этот механизм обновления.

Ну и конечно: всегда делай ТИИ. На битых базах - это единственный выход."

(0) зачем так? Можно ведь стандартно - в параметрах запуска пишешь

/СОбновлениеИнформационнойБазы

Возьмем на заметку