Есть пара удержаний - возмещение ущерба и возврат излишне выплаченной з/п.
В ЗУП реализовано через "удержание в счет расчетов по прочим операциям".
Но сам расчет там либо фиксированной суммой, либо по формуле.
На практике применяется расчет аналогичный исполнительным листам. Т.е. процентом от з/п до достижения суммы.
Если исходить из типового механизма, то потребуется ввести 3 одинаковых удержания - суммой, расчетная база общая, расчетная база без больничных листов.
Есть другие решения?

Я так понимаю появятся новые виды ИЛ в перечислении? Допиши формирование регистра "плановые удержания" при проведении ИЛ на основании выбранного вида.

+(1)
ПлановыеУдержания
ПолучателиУдержаний
ПредельныеСуммы
УдержанияДоПредела

все оказывается еще проще ))
заведи новые удержания с назначением "Исполнительный лист".
В самом документе ИЛ просто выберешь нужное удержание.
Профит