Подскажите, пожалуйста, как правильно оформить сложившуюся ситуацию.

В декабре сотруднику 28-29 числа начислили отпуск. Декабрь закрыли. Перенесли данные в новую базу. ЗУП 3.1.4.169.
Параллельно продолжаем вести учет и в старой базе ЗУП 2.5.127.1

В январе сотрудник приносит БЛ за период 27.12.2017 по 10.01.2018.

Надо отразить БЛ, сторнировать отпуск, отразить второй БЛ на основании первого БЛ, начислить новый отпуск, отразить БЛ через Пилотный проект.

В старой базе все легко, а в новой то декабрьских документов нет.

Научите пожалуйста.

Администрирование - Переносы данных. Ищем нужные регистры, удаляем записи, создаем нужные документы.

Какой вариант переноса был? С взаиморасчетами или срез на начало эксплуатации?

перенос упрощенный - остатками

(1) то есть вы имеете в виду, ввести в  базу 3.1 декабрьские документы, и с учетом их сумм откорректировать перенесенные остатки?

В вашей ситуации проще завести БЛ, обнулить исправительную сумму по Отпуску. Ввести новый Отпуск продление и в нем тоже сумму обнулить, но период оставить

При перерасчете же Сумма Отпуска не изменилась

(6) при продлении имел ввиду

(6) сумма отпуска изменилась, так как теперь используется другой расчетный период - включается декабрь - новый отпуск в январе. В старой базе в декабре отработанных дней берет меньше, так как  в январе БЛ их сторнировал.
В новой базе этот же БЛ ничего не сторнировал и отпуск берет в декабре для расчета больше на 2 дня.

Не должна вроде сумма меняться при продлении отпуска после БЛ

(9) в документе-исправлении отпуск приходится на другие дни. На январь, база для расчета среднего заработка сдвинулась по времени на один месяц. учтенные дни за декабрь в базах получились разными