Собственно вопрос выше. все бекапы это архив *.1cd. Выгрузка в *.dt тоже выдает ошибку.

без опыта и инструмента в этом деле особо нечего делать.
в среднем - дешевле с последнего живого бекапа восстановить все вручную.

вылетает то когда ? в конфигуратор зайти можно или тоже нельзя.

(0) Самый дубовый вариант:
- создать новую базу из такого же cf (убедиться, что он не глючный)
- перенести данные через ВыгрузкаЗагрузкаXML

(2) в конфигуратор заходит, и в базу тоже. но некоторые отчеты и обмен приводят к вылету базы.
(3) база на 5 Гб, будет сложно
(1) какие инструменты можно использовать?

(4) 5Гб - ни о чем. Вот если бы 50, другое дело.

(4) вырезайте их из конфигуратора , обновляйтесь а потом вернете .. я помню так веселился с какими то формами НДС и прибылью.

(5) перенос будет долгим, при это я более чем уверен, что при выгрузке в xml  база тоже будет вылетать

(7) я недавно делал. Ничего не вылетает.

(6) там скорее регистр бухгалтерии бит, потому что все бух отчеты вылетают.
(7) базы не летят одинаково... но как вариант  - принял

есть ли возможность выгрузить базу в dt без конфигуратора?

(9) может два одинаковых субконто на счете, видел такое несколько раз

(11) проверю, но в этой фирме врядли