Здравствуйте!
Без выплат по начисления в справку 2-НДФЛ (ну и регистры) все встает красиво и как надо. После выплат же ничего не понятно. Больничный января попадает на февраль, больничный февраля как-то делится между февралем и мартом. Хотя вся ЗП за февраль выплачена в феврале. Можно сделать просто по начислениям учет, а не по выплатам?

НДФЛ разделяется на начисленный и удержанный.
так что не делать "по выплатам" - не получится

А если на основе документа начисления, сразу делать движения по НДФЛ удержанный, как это было в ЗУП 2.5? Сильно опасно?

(2) не имеешь права.
это прокатит только в случае когда день выплаты совпадает с днем начисления.

(3) у нас так и есть. Просто документы формируют на разные даты и бардак. В целом у нас всегда дата начисления равна дате выплаты.

(4) Это неверно.
Крайний срок выплаты ставиться на начало след. месяца и считается датой выплаты.

6-НДФЛ. Отсюда и весь "бардак".
Вот "классика маразма", обратите внимание на "год" в учете доходов и НДФЛ.
http://nalog-nalog.ru/ndfl/raschet-6-ndfl/kak_pravilno_otrazit_bolnichnyj_v_6ndfl_primer/#Особенности %D0%BF%D0%B5%D1%80%D0%B5%D1%85%D0%BE%D0%B4%D1%8F%D1%89%D0%B5%D0%B3%D0%BE %D0%B1%D0%BE%D0%BB%D1%8C%D0%BD%D0%B8%D1%87%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%BE %D0%BB%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%B0: %D0%BE%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%B6%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5 %D0%B2 %D0%B4%D0%B5%D0%BA%D0%BB%D0%B0%D1%80%D0%B0%D1%86%D0%B8%D0%B8 6-%D0%9D%D0%94%D0%A4%D0%9B

Упс.
http://nalog-nalog.ru/ndfl/raschet-6-ndfl/kak_pravilno_otrazit_bolnichnyj_v_6ndfl_primer/
Там пункт
Особенности переходящего больничного листа: отражение в декларации 6-НДФЛ

(0) https://ic.pics.livejournal.com/bobik_58/74363174/31978/31978_900.jpg