После переходы с 2.0 на 3.0 "задваиваются" взносы, точнее они начислются  и по основному виду деятельности и по ЕНВД.

Релиз 3.0.62.17

Кто сталкивался?

Не актуально. Кто-то ввёл документ документ "Операция учёта взносов".