Имеем:
Чек с выделенным НДС.
Предписание аудитора о списании НДС без счет-фактур на 91.01 Прочие расходы через 19.03

Проводки следующие
Пример: бумага, цена 118 руб, в т.ч. ндс 18 руб., купленные в подотчет:
Дт 19.03 ""Контрагент"" (--без понятия, что тут за контрагент--) 18 руб.
Дт 10 (субсчет задается в номенклатуре) Кт 71.01 ""Работники организации"" (подотчетное лицо из ав/отчета) 100 руб.
Дт. 91.02 ""Статья затрат"" (В нашем случае Другие расходы (не принимаемые) 4.5.7.5) 18 руб."
ПРи этом Дт 91.02 БУ 18 руб, а в ну 18 руб. идут в ПР (постоянные разницы)

Прошу помочь если не ссылкой на типовое решение, то указать на возможные последствия описанной тут схемы учета

Не забудьте списать НДС документом, не проводкой, т.к. в БП3 помимо проводок еще есть регистры подсистемы НДС, и они должны по такому НДС выводиться в ноль, что бы не оставалось "хвостов" при формировании книги покупок.

и почему статья списания НДС указана вами, как НЕ принимаемая к НУ?

(0) А почему вы решили списать эту сумму? почему не взять в зачет?

(1) видно последствия прочтения письма минфина от 24 января 2017 г. N 03-07-11/3094. (если нет фактуры, то нет права на вычет и и не имеете право включать сумму НДС в расходы.), хотя это письмо и противоречит НК РФ и решениям суда