При синхронизация данных ЗУП3 <-> УПП, в последней не проводятся созданные документы. Они попадают в список непроведенных документов и проводятся без проблем и ошибок, если все выделить и нажать кнопку Провести.
Таким образом обмен ведет себя когда вызываешь его из ЗУП3. Если вызвать обмен из тонкого клиента УПП, документы проводятся сразу и никаких нареканий на обмен нет.