Не пойму какая тут логика. Загружаю выписки, в части Поступлении на рс заполняется Счёт на оплату, а в части нет. от чего это зависит?

Ну, как минимум от наличия счета на оплату в инфробазе

(1) А как максимум?

(2) Соответствие договора (который проставляется в Поступлениии на р/сч) договору в счёте...