Конфигурация: Зарплата и Управление Персоналом, редакция 3 (Релиз 3.1.7.144)
При проведении документа "Увольнение" выходит ошибка "Запись с такими ключевыми полями существует, Регистр сведений плановые начисления"
В самом регистре записей за 2018 год по этому сотруднику нет. Получается дублирующие записи делаются документом увольнение т.к. запись которая выходит в тексте ошибки стоит следующим днем в 00:00:05

Он пытается прекратить плановые начисления. У вас случайно не назначено, например, два разных оклада сотруднику? Т.е. визуально они могут выглядеть одинаково, но это два разных элемента Плана вида расчетов