(0) не путай теплое с мягким
это два совершенно разных механизма и проверяют разные вещи
ошибка "Обнаружено нарушение целостности системы" вываливается, если 1с находит на компе следы взлома системы управления плиты платформы,
а механизм Проверки лицензионного использования проверяет право на установку обновлений конфигурации по данным зарегистрированных ПП в личном кабинете на портале и наличие подписки ИТС - ему глубоко фиолетово, какая платформа используется, с лицензией или без