как сделать <!--     --> не работает

в каком смысле не работает? Внутри тега не будет работать

Ошибка разбора XML:  - [23937,28]
Фатальная ошибка:
Comment must not contain '--' (double-hyphen)

Все работает

Читать надо с использованием ПараметрыЧтенияXML

Хотя и без него работает - просто узлы-комментарии опускаются

<!--            <Правило>
                <Код>ПроизвольныйЭД</Код>
                <Наименование>Документ: Произвольный электронный документ</Наименование>
                <Порядок>3400</Порядок>
                <СинхронизироватьПоИдентификатору>true</СинхронизироватьПоИдентификатору>
                <Источник>ДокументСсылка.ПроизвольныйЭД</Источник>
                <Приемник>ДокументСсылка.ПроизвольныйЭД</Приемник>
                <Свойства>
                    <Свойство Поиск="true">
                        <Код>1</Код>
                        <Наименование>Дата --&gt; Дата</Наименование>
                        <Порядок>50</Порядок>
                        <Источник Имя="Дата" Вид="Свойство" Тип="Дата"/>
                        <Приемник Имя="Дата" Вид="Свойство" Тип="Дата"/>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>2</Код>
                        <Наименование>ДокументОснование --&gt; ДокументОснование</Наименование>
                        <Порядок>100</Порядок>
                        <Источник Имя="ДокументОснование" Вид="Реквизит" Тип="ДокументСсылка.ПроизвольныйЭД"/>
                        <Приемник Имя="ДокументОснование" Вид="Реквизит" Тип="ДокументСсылка.ПроизвольныйЭД"/>
                        <КодПравилаКонвертации>ПроизвольныйЭД                                    </КодПравилаКонвертации>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>3</Код>
                        <Наименование>Комментарий --&gt; Комментарий</Наименование>
                        <Порядок>150</Порядок>
                        <Источник Имя="Комментарий" Вид="Реквизит" Тип="Строка"/>
                        <Приемник Имя="Комментарий" Вид="Реквизит" Тип="Строка"/>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>4</Код>
                        <Наименование>Контрагент --&gt; Контрагент</Наименование>
                        <Порядок>200</Порядок>
                        <Источник Имя="Контрагент" Вид="Реквизит" Тип="СправочникСсылка.Контрагенты"/>
                        <Приемник Имя="Контрагент" Вид="Реквизит" Тип="СправочникСсылка.Контрагенты"/>
                        <КодПравилаКонвертации>Контрагенты                                       </КодПравилаКонвертации>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>5</Код>
                        <Наименование>Направление --&gt; Направление</Наименование>
                        <Порядок>250</Порядок>
                        <Источник Имя="Направление" Вид="Реквизит" Тип="ПеречислениеСсылка.НаправленияЭД"/>
                        <Приемник Имя="Направление" Вид="Реквизит" Тип="ПеречислениеСсылка.НаправленияЭД"/>
                        <КодПравилаКонвертации>НаправленияЭД                                     </КодПравилаКонвертации>
                    </Свойство>
                    <Свойство Поиск="true">
                        <Код>6</Код>
                        <Наименование>Номер --&gt; Номер</Наименование>
                        <Порядок>300</Порядок>
                        <Источник Имя="Номер" Вид="Свойство" Тип="Строка"/>
                        <Приемник Имя="Номер" Вид="Свойство" Тип="Строка"/>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>7</Код>
                        <Наименование>Организация --&gt; Организация</Наименование>
                        <Порядок>350</Порядок>
                        <Источник Имя="Организация" Вид="Реквизит" Тип="СправочникСсылка.Организации"/>
                        <Приемник Имя="Организация" Вид="Реквизит" Тип="СправочникСсылка.Организации"/>
                        <КодПравилаКонвертации>Организации                                       </КодПравилаКонвертации>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>8</Код>
                        <Наименование>ПометкаУдаления --&gt; ПометкаУдаления</Наименование>
                        <Порядок>400</Порядок>
                        <Источник Имя="ПометкаУдаления" Вид="Свойство" Тип="Булево"/>
                        <Приемник Имя="ПометкаУдаления" Вид="Свойство" Тип="Булево"/>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>9</Код>
                        <Наименование>Прочитан --&gt; Прочитан</Наименование>
                        <Порядок>450</Порядок>
                        <Источник Имя="Прочитан" Вид="Реквизит" Тип="Булево"/>
                        <Приемник Имя="Прочитан" Вид="Реквизит" Тип="Булево"/>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>10</Код>
                        <Наименование>СтатусДокумента --&gt; СтатусДокумента</Наименование>
                        <Порядок>500</Порядок>
                        <Источник Имя="СтатусДокумента" Вид="Реквизит" Тип="ПеречислениеСсылка.СтатусыЭД"/>
                        <Приемник Имя="СтатусДокумента" Вид="Реквизит" Тип="ПеречислениеСсылка.СтатусыЭД"/>
                        <КодПравилаКонвертации>СтатусыЭД                                         </КодПравилаКонвертации>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>11</Код>
                        <Наименование>Текст --&gt; Текст</Наименование>
                        <Порядок>550</Порядок>
                        <Источник Имя="Текст" Вид="Реквизит" Тип="Строка"/>
                        <Приемник Имя="Текст" Вид="Реквизит" Тип="Строка"/>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>12</Код>
                        <Наименование>ТипДокумента --&gt; ТипДокумента</Наименование>
                        <Порядок>600</Порядок>
                        <Источник Имя="ТипДокумента" Вид="Реквизит" Тип="ПеречислениеСсылка.ТипыЭД"/>
                        <Приемник Имя="ТипДокумента" Вид="Реквизит" Тип="ПеречислениеСсылка.ТипыЭД"/>
                        <КодПравилаКонвертации>ТипыЭД                                            </КодПравилаКонвертации>
                    </Свойство>
                    <Свойство>
                        <Код>13</Код>
                        <Наименование>ТребуетсяПодтверждение --&gt; ТребуетсяПодтверждение</Наименование>
                        <Порядок>650</Порядок>
                        <Источник Имя="ТребуетсяПодтверждение" Вид="Реквизит" Тип="Булево"/>
                        <Приемник Имя="ТребуетсяПодтверждение" Вид="Реквизит" Тип="Булево"/>
                    </Свойство>
                </Свойства>

                <Значения/>
            </Правило>                                                                                                                                  
-->

Твоя ошибка говорит о том, что внутри комментария не должно быть двойных дефисов

Меняй наименования ПКС, там "-->" стрелочки не прокатят :)

*ПКО