Есть обработки поиск и замена дублирующих объектов 8.2 в УПП, УТ 10.3 на обычные формы и есть обработка "Поиск и замена дублей" в БП, ЗУП под управляемые формы.
Старая обработка без вопросов меняла элементы. А новая регулярно говорит: не могу заменить, дата запрета изменения действует и т.п.
IMHO:
при замене обменДАнными=истина
и в проверки не заходит
или привилегированное что-то
а запускаешь под одним и тем-же пользователем
посмотри уже внутрь
(2) в общем случае "ОбменДанными.Загрузка = Истина" не гарантирует отключение проверок. Отключение (или не отключение) этих проверок лежит на разработчики конфигурации.