Такое возможно? Например есть "Список" документов. У документа есть табличная часть "Товары". Нужно оформить строки, например, если в табличной части "Товары" есть Номенклатура.Наименование = "Товар12345", то цвет фона строки документа желтый.

(0) Нет Условное оформление так не может.
Надо допиливать текст запроса ДС как минимум

Или выводить признак особой покраски в реквизит документа

можно
делаешь запрос с Объединить ВСЕ:
1-я часть отбирает документы у которых в ТЧ есть товар Товар12345
2-я часит отбирает документы у которых в ТЧ нет товара Товар12345.
Добавляешь в запрос новое поле ЕстьТовар12345:
1-я часть значение Истина
2-я часть значение Ложь.
И далее по нему раскрашиваешь

В ЗУП на ОФ список сотрудников строкой в шапке документа именно для этого был сделан )