Доброго времени.
Никогда не задавался подобным вопросом. Всегда обходился просто созданием новых Организаций.

А вот теперь думаю. Может есть механизм в УПП  который необходимо включить и настроить для ведения учета в разрезе Холдинга и всех его организаций.  Или это только подразделениями / ЦФО  можно делать?

Там сотни механизмов, часть из них нужно включить, состав включаемых зависит от целей ведения учёта.

(1) брехня
нет в УПП ничего, кроме обособленных подразделений

(2)
на самом деле Вас и ждал тут.. Знаю что в теме УПП Вы компетентны !  

Смысл в том что хотелось видеть дерево где вверху головная организация "Холдинг" а в ней куча других со своим Банковским счетом.

Для обособки если не ошибаюсь добавить счет не получится.

(3) ну нарисуй фин.директору в бюджетировании дерево с банковскийми счетами - в чём вопрос ?

А следующим вопросом будет как исключить внутригрупповые обороты в группе компаний в УПП?

(4) Нарисовать  и допилить это понятно.. =) я про типовые  функции интересуюсь.

Например Документ "План движения ДС" не имеет реквизита "Организация".  

Соответственно отчет  Сравнительные анализ движени ДС тоже не сформировать в разрезе Организаций.

(6) поток сознания

Надо сначала выписать требования, что хочет директор. Потом уйти с этим списком, по каждому пункту провести эксперимент в базе, предложить какое-то обходное решение или сказать, что такой функции нет. Ну и далее результаты показать директору. Пусть решает, нужна ли ему такая частичная автоматизация или нет.

Выбрал конкретную организацию в отчёте - получил данные по ней. Не выбрал - получил по всем. Отбор есть не везде, что-то потребуется дописать/переделать/забить/отразить иначе.