Синхронизация УТ11-БП3 Обособленные подразделения
Та же самая проблема, в ут не учтены обособленные подразделения не на отдельном балансе, а те что создаются в справочнике организаций с видом Обособки, это подразделения на отдельном балансе, которые при синхронизации с БП, в ней встают на отдельный баланс. Проблема к разработчикам в 1С, почему не учесть (обособки как в БП КОРП) и синхронизировать обособки не на отдельном балансе ут11.4 - бп3.0 КОРП??? непонятно...

Если у вас обособки НЕ на отдельном балансе, то почему просто не завести подразделение вместо организации? КПП можно подвязывать к подразделению

(0) "в ут не учтены обособленные подразделения не на отдельном балансе" - вообще то учтены и называется это справочник Структура предприятия. Также если бы вы в справочнике организации открыли бы справку то увидели бы:

Обособленные подразделения без выделения на отдельный баланс
Для обособленных подразделений, невыделенных на отдельный баланс, данные о регистрации в налоговом органе указываются по команде Регистрации в налоговом органе панели навигации формы Организация.
Операция доступна для всех подразделений, которые зарегистрированы в справочнике Структура предприятия. Для указания того, в каком налоговом органе должно быть зарегистрировано обособленное подразделение используется механизм drag and drop (перетаскивание подразделения (объекта) с помощью мыши из правой панели диалогового окна в левую панель, где указаны доступные ИФНС).