Так и должно быть?

Смотря что за подписка? На какое событие

(1) ОбработкаПроведения

Подписки на событие "При проведении" документа
Важно понимать: если в обработке проведения документа или в подписках на событие, вызванных ранее, не происходила запись движений регистров в явном виде (Движения.Регистр.Записать()), то движения документа еще НЕ записаны в базу. Поэтому их нельзя получить с помощью запроса, но можно получить из коллекции движений источника.
Процедура ПриПроведенииДокумента(Источник, Отказ, РежимПроведения) Экспорт
          Регистр = Источник.Движения.Бухучет;
.....
КонецПроцедуры

(3) Точно! Спасибо!

"Так и должно быть?" - да. Причем замечу: если читать запросом движения во время проведения, то можно прочитать то, чего там не будет после проведения :) Парадокс? В некоторых конфигурация нет, не парадокс :))