Вопрос собственно в сабже.

Документ Поступление товаров и услуг. Счёт на электроэнергию. Если ставить «НДС учитывать в стоимости», такого сообщения не выдает. Если убрать предупреждение как на скриншоте.
Посмотрел как раньше бухи делали, они всегда ставили "НДС учитывать...". Новый же говорит, что "Этот ндс мы имеем право принять к вычету, зачем включать его в стоимость".

Но по идее же электроэнергия включает ндс, верно? Гуглом видимо как то не правильно пользоваться умею, инфы нормальной не нашёл.

Правильно новый бух говорит.
Если у вас деятельность с выпуском продукции или оказанием услуг с НДС, то на вычет можно поставить все расходы с НДС.
Должны быть какие-то причины, которые не позволяют этого сделать.
Может эти причины были ранее, а затем пропали, но по привычке бух продолжали принимать НДС с учетом в стоимости. Подавать на вычет по НДС - право, а не обязанность.

а почему Вы ещё не разорились?