В модуле объекта описал процедуру для установки своей автоматической нумерации:

Процедура ПриУстановкеНовогоНомера(СтандартнаяОбработка, Префикс)
    СледующийНомерДокумента = ПолучитьСледующийНомерДокумента();
    НомерТекущегоМесяца = Месяц(ТекущаяДата());
    Префикс = "0000"+Строка(СледующийНомерДокумента)+"/"+Строка(НомерТекущегоМесяца);
КонецПроцедуры

Длина номера - 9. Программный код работает если, СледующийНомерДокумента двухзначное число.

Подскажите, как переделать, чтобы нумерация была корректна для любой разрядности СледующийНомерДокумента?

(0) формат используй с бланкирование в форматной строчке

Функция Формат() вам в помощь. Выводить лидирующие нули.

(0) Ну очевидно же, что увеличить длину номера с 9 до сколько там тебе надо

Или вместо этой хрени "0000"
Используй функцию БСП СтроковыеФункцииКлиентСервер.ДополнитьСтроку

(4) спасибо

через слэш в счф указывается номер обособленного подразделения.
так что для счф данная нумкпация - есть бяка.