Есть документ самодельный документ "Задача сотруднику".

Каждые 5 секунд должна происходить проверка новых задач для сотрудника или его подчиненных.
При открытии задачи, выполнении и т.д будет происходить запись регистра.

Вопрос. Как сделать так, чтобы было минимальное кол-во блокировок и конфликтов

А механизм задач чем не угодил ?

(0)регистр регистру рознь (РС, РБ, РР), но и между регистрами идентичной структуры хранения данных могут быть разные настройки (наличие-отсутствие итогов и т.п.). Вам читать нужно или писать каждые 5 секунд? Если блокировки управляемые и никто не пишет - да хоть 100500 юзеров будет одновременно читать - никто ни кому не помешает.

Могу понять необходимость писать в регистр при выполнении задачи, а при открытии зачем? И не понятно что за регистр планируется: РС или РН, РБ, РР. Везде свои нюансы есть.
Сделайте более четкую постановку задачи.

На 8.3 RCS никто блокировать никого не будет

(1) +500

А ещё есть планы обмена для регистрации изменений...

(0) >При открытии задачи ... будет происходить запись регистра

Вот эту чушь убери и все норм будет.
Ну и READ_COMMITTED_SNAPSHOT.

(4) Можно подробней что за RCS?

(8) -> (7)

(0) Поставьте на этом вашем высоконагруженном регистре жирный крестик. И это будет самое лучшее проектное решение.

(0) РС. Независимый, непериодический, структура измерений:

Сотрудник
Состояние
Задача

Измерения не индексированы, не ведущи.

(11)
Сотрудник можно сделать Ведущим.