Сертификат проходит по кассе дважды: первый раз, когда я его продаю, он идет в выручку и проходит в чеке как Способ расчета - АВАНС
второй раз он попадает в выручку, когда я его гашу. В этому случае он идет в чеке отдельной строкой Зачет предоплаты (аванса) наряду с наличными и/или безналом
Насколько я понимаю это правильно, но у меня идет задвоение выручки, а на основании выручки я рассчитываю переменную часть зарплаты продавцам. Как решается эта проблема?

"второй раз он попадает в выручку, когда я его гашу"//с какой радости он попадает в выручку?

возвраты по товарам тоже в выручку пишешь?

(0) Что такое "Выручка" в вашем понимании? Сумма всех типов оплаты или только Наличные+Безналичные?