При настройке ВПН указано что весь трафик пользователя заворачивается в ВПН. Так проще настраивать. Но при этом да, интернет как правило пропадает.
Где именно указано зависит от типа ВПН.
(3) Это зависит от того, как организован доступ к БД 1С. Может быть сервер терминалов, может быть веб-сервер и т.д.
Нужно уточнить у того, кто настраивал этот сервер, чтобы настроить подключение.
Оптимист верит, что мы живем в лучшем из миров. Пессимист боится, что так оно и есть.