При обмене между двумя базами в базе приемнике нужно искать объект по значению реквизита "УИД_УТ". В базе источнике это УникальныйИдентификатор() объекта.
Сейчас ищет по наименованию и коду, выглядит это так:
___________________________________________________________________________
Процедура ДобавитьПКО_Справочник_Номенклатура_Получение(ПравилаКонвертации)
У тебя не по УИД а по реквизиту УИД_УТ. Попробовать в ПКО "..._Отправка" добавить твой реквизит в ДанныеXDTO как свойство. А в ПКО "...Получение" оставить его одного в полях поиска. Но это так, как идея.