Как вы обновляете типовые если переделаны предопределенные счета в плане счетов?
Или же вот предопределенные виды субконто тоже изменены.

Я вот при обновлении вынуждено просто перед сохранением добавлять и редактировать эти предопределенные.
а с ПС часто стараюсь вернуть типовой план счетов по возможности если нет то тоже редактирую.
Нет других более удобных механизмов?

есть вариант объединить

(1) При объединении эти пункты вытеснят все.

(0) ну и сними привязку к предопределенному счету у этих счетов.

да и обновляй. Единственное, код счета может совпадать