УТ11. Пользователей 50. 500-700 новых документов в день. база 40Гб. Есть ли смысл делать полную реорганизацию ежедневно или можно 1 раз в неделю ?

на данный момент реорганизация занимает 1,5 часа.

В интернете есть скриптик, который определяет, что нужно делать с индексом. Перестраивать, дефрагментировать или не трогать.
Если просто - смотри процент фрагментации. Если > 50%, то перестройка, если > 15% - дефрагментация

От реорганизации еще никому не было плохо.
Ее не делают только из-за того, что она долгая и/или создает нагрузку, не укладывающиеся в тех. окно.

в тех.окно укладываемся, а лучшее может быть врагом хорошего)

(2) >> В интернете есть скриптик.

Вот тут, например, http://catalog.mista.ru/public/803209/#comm .

>> Если > 50%, то перестройка, если > 15% - дефрагментация.

MS рекомендует от 5 до 30%% - дефрагментация, выше 30%  - перестроение.
Но точные параметры принципиальны только для высоконагруженных систем и определяются опытным путём.

(3) >> Ее не делают только из-за того, что она долгая и/или создает нагрузку, не укладывающиеся в тех. окно.

Делать то её конечно всё равно нужно. Но когда реорганизация становится слишком длительной и не укладывается в технологическое окно, приходится прибегать к чуть более сложным схемам обслуживания, чем тупое полное перестроение индекса каждую ночь.

(4) >> лучшее может быть врагом хорошего)

Не в этом случае. Лишняя реорганизация может быть избыточной или не укладываться в технологическое окно, или нагружать сервер , но вряд ли она может что-то испортить.