Я затеял заказать 50000 кодов по упрощенной схеме.
Указываю код например 62 и 50000, ввожу в оборот, распечатываю и всю оставшуюся жизнь клею их на свой товар.
Я правильно понимаю все это?

Плюсы, минусы, подводные камни?

Должен будешь потом доказывать что у тебя на остатках было такое количество.

(1) с чего такие выводы?
(0) плюсы очевидны: не потеряешься, на какую единицу товара какую наклейку клеить, можно раздать даже одноклеточным и вперед.
минусы тоже: без двойного сканирования не обойтись (конечно, если при продаже товар не подбирается вручную), в Честном Знаке весь товар с остатков будет на одно лицо. У меня с автопокрышками примерно такая же история была - решил эмитировать обезличенные КМ с наименованием товара "Остатки. Автошины и автопокрышки", как предлагается что в документах ЧЗ, что в лектории 1С. Хорошо, что эмитировал тысячу КМ - сотни две расклеил, потом забил на них. Удобнее оказалось создавать заказы на эмиссию по остаткам инвентаризации. В итоге сейчас работаю небольшими партиями - эмитировал, распечатал, обклеил. Понятное дело, с автошинами другая специфика, но в целом подход такой может быть. Посмотрите https://its.1c.ru/video/lector20200604-4 У меня не используется агрегация КМ, поэтому в чем-то проще. Начните с десятка коробок (или какие у Вас упаковки), втянитесь в процесс))

(0) Главное не заказывай печать больше 500 за 1 раз, иначе в PDF не дадут скачать, только CSV :)