Из документа ПТУ нужно выгрузить таблицу с колонками:
Номенклатура, Штрихкод, Серия, Сертификат.
С номенклатурой и серией всё понятно: они есть в самом документе. Штрихкоды лежат в РегистрСведений.ШтрихкодыНоменклатуры. Сертификаты лежат в РегистрСведений.ОбластиДействияСертификатовНоменклатуры.

Требуется выбрать номенклатуру, серию, штрихкоды по условию совпадения номенклатуры и сертификаты по условию совпадения номенклатуры и серии. Штрихкод у номенклатуры один, сертификатов у серии может быть несколько.

Традиционное: что таки уже сам сделал, что получилось, что не получилось?

(1) Выгрузил в ТЗ из табличной части документа колонки Номенклатура и Серия. Теперь не знаю как составить запрос, сверяющийся со строчками этой ТЗ.
Могу сделать два отдельных списка по номенклатуре и сериям и два отдельных запроса. Но хочется получить выборку одним запросом. Если это возможно.

(0)
Получаешь запросом таблицу с ШК, потом делаешь соединение по ШК таблицы к самой себе с условием левая таблица по ключевым полям не равна правой.