УПП 1.3
Принесли больничный в электронном виде, нужно настроить обмен с ФСС.
Есть инструкция
https://its.1c.ru/db/elreps/content/15/hdoc
Сертификат ФСС скачивается по ссылке
http://fss.ru/ru/fund/download/282307/index.shtml ("Квалифицированный сертификат открытого ключа подписи уполномоченного лица для подписи квитанции о приеме расчета ГОСТ Р 34.10-2012")
Сертификат ФСС ЭЛН
https://lk.fss.ru/cert.html ("Сертификат уполномоченного лица ФСС 2020 (алгоритм ГОСТ Р 34.11—2012/34.10—2012)")
Но по факту скачиваются два одинаковых файла.
Я что-то не так понимаю или не ту инструкцию смотрю?

Все нормально, разные файлы скачиваются.
По первой ссылке 2 файла
Фонд социального страхования Российской Федерации ГОСТ Р 34.10-2012_20200909 .cer
Фонд социального страхования Российской Федерации.cer

по второй ссылке
FSS_PROD_CERT_2021.cer

(1) там еще две ссылки для
Сертификаты головного удостоверяющего центра
https://e-trust.gosuslugi.ru/#/portal/mainca
Корневой сертификат УЦ ФСС РФ
https://e-trust.gosuslugi.ru/#/portal/accreditation/accreditedcadetails/1027739443236
и написано, что "Рекомендуется установить все"
Т.е. качать все сертификаты по ссылкам и устанавливать?