нужно выкинуть из ведомости по партиям (база - УПП) перемещения по тем же складам, что и указаны в отборе - типа это все равно внутри и создает лишние движения.

в запрос добавил "
        |ГДЕ
    |    НЕ(ИсточникДанных.Регистратор ССЫЛКА Документ.ПеремещениеТоваров
    |                И ИсточникДанных.Регистратор.СкладПолучатель В (&СписокСкладов)
    |                И ИсточникДанных.Регистратор.СкладОтправитель В (&СписокСкладов))"

в отчете сделал галку "Кроме перемещений", при выборе галки меняется запрос со стандартного на мой, в Универсальном отчете проверяется наличие в отчете галки, наличие отбора по складам, устанавливается параметр запроса для построителя отчета.
когда формирую с группировкой по документу-регистратору, все норм, когда просто оставляю одну группировку "номенклатура" - условие пропадает, почему?

В обычной ситуации я б просто не выводил группировку документа-регистратора, а как тут сделать?

Потому что построитель умный, видит, что от него не хотят регистратора, поэтому он выкидывает его из виртуальной таблицы.

(2) это понятно - потому что условие не работает. Что делать-то?

Не пользоваться построителем...

Не надо ничего менять в запросах. Надо просто условие сделать в фигурных скобках

(4) не помогло.

в итоге как получилось, чтоб заработало условие:
кроме условия добавил:
    "...
        |ПО
    |    ОБЩИЕ,
    |    Номенклатура,
    |    Регистратор
    |{ИТОГИ ПО..."

типа обязательные итоги по номенклатуре и регистратору - тогда построитель не игнорит уловие.
фигурные скобочки не помогли совсем.