Формирую операции по НДС налогового агента. Всё получилось, до момента формирования записей книги покупок и отражения в декларации. Нужная запись попадает в документ формирования записей книги покупок, однако после проведения документа не формируются нужные записи регистра "НДС покупки" и расход по "НДС предъявленный", а также, соответственно, не отражается в декларации. Может, кто-то сталкивался?

(0) отладчик рулит!

Заполняется по кнопке само? А хоть какие-то движения делает? 68 - 19 проводки появляются?

(0) конфигурацию озвучь и картинки показывай

(0) Если речь про БП 3.0, то что-то с трудом вериться в правдивость ситуации.
Если табличная часть заполняется (автоматически или вручную - неважно), то при проведении сформируются записи по НДСПредъявленный и НДСЗаписиКнигиПокупок в любом случае. Там нет никаких фильтров или дополнительных проверок - что в табличной части, то и в регистры летит (т.н. безусловное проведение). Исключение - организация не является плательщиком НДС или ведется упрощенный учет НДС. Но упрощенный учет НДС не предусматривает учета НДС налогового агента и вообще использование регламентных документов "Формирование записей книг".