На основании ПередачаТоваровХранителю реально создается документ РасходныйОрдерНаТовары, при этом в конфигураторе ПередачаТоваровХранителю не установлен основанием для РасходныйОрдерНаТовары в структуре подчиненности.

В результате поиска по модулю строк "РасходныйОрдерНаТовары.СоздатьДокумент()" выходит 4 соответствия, но ни одно не задействовано при проведении ПередачаТоваровХранителю,
при котором создается РасходныйОрдерНаТовары.

Что я делаю не так, где еще можно увидеть процесс создания РасходныйОрдерНаТовары на основании ПередачаТоваровХранителю?

Поставь точку останова в ОбработкаЗаполнения или на худой конец в ПередЗаписью и по стеку посмотри

замер производительности поможет.

(1) я включил замер производительности, который показывает все задействованные строчки в процессе, при проведении нужного документа ни одна строчка обработки заполнения не задействована.

Ну и кроме того, в замере производительности нет никаких созданий в задействованных строках

(4) Фоновое задание же.

(5)
тексты регламентных заданий лежат в общем модуле, я делал по нему поиск, там нет создания документа, который создается.

(6) Кто-то упоминал регламент?

(7)
Я что-то не понимаю, всегда считал, что фоновые задания это запущенные регламентные задания?

(8) Почитай про разницу.

(9)
Фоновое задание — объекты, порождаемые регламентным заданием.

(10) Прекрасно. Читай дальше.

(11)
Имя метода — путь к процедуре, которая будет выполняться в фоновом задании по заданному расписанию. Процедура должна находиться в общем модуле. Рекомендуется не использовать типовые общие модули, а создать свой. Не забудьте, что фоновые задания исполняются на сервере

(12) См. общие модули ДлительныеОперации*

там скорее всего что-то типа МенеджерДокумента.СоздатьДокумент() поэтому и найти не можешь

(14)
"СоздатьДокумент(" не находится в строках замера производительности, при котором документ реально создался.

У самого еще есть гипотеза, что задействованы внешние обработки, тексты которых в конфигурации и замере не отображаются. Но как их найти - вопрос.

(16) В справочнике внешних обработок.

СозданиеСвязанныхОбъектов

(15) Запусти что-то вроде:
    
    ФЗ = ФоновыеЗадания.ПолучитьФоновыеЗадания();
    Для Каждого ФоновоеЗ ИЗ ФЗ Цикл
        Если ФоновоеЗ.ДатаНачала > ТекущаяДата() - 600 Тогда
            Сообщить(ФоновоеЗ.ИмяМетода);
        КонецЕсли;
    КонецЦикла;

Сразу после создания ордера. И посмотри какие методы вызывались в фоновых.

точку останова при создании и в обратку смотри