Собственно, вопрос в том, возможно ли в разделах Такси пункты настроить по алфавиту.

Например в Бухгалтерии 3.0, раздел "Администрирование" содержит "Настройки программы", где еще можно руками поменять порядок, а в
"Сервис", где полтора десятка пунктов свалены в одну кучу, неясно как. Как бы их сортировать по алфавиту? Или руками поменять порядок?

руками в польз.режиме,
руками в конфигураторе,
выгрузить конфу в файлы и там отсортировать чем угодно
расковырять пользовательские настройки и там отсортировать чем угодно

Настройка расположения пунктов руками в пользовательском режиме делается через Шестеренку "Настройка навигации" и "Настройка действий".

(2) продолжайте вести наблюдение