И узнать список этих модулей

Задать вопрос на форуме

Как вариант, в конфигураторе можно посмотреть.

Поиск чего нибудь простого, слова процедура например, глобально запустить.
В ошибках будет список закрытых модулей в том числе.

Выгрузить в файлы

(3) гм? Не закрытых, а без текстов.
Можно выгрузить в файлы и посчитать *.Bin файлы