СКД програмная установка отборов при открытии формы:
    ЭлементыОтбора = ОтчетОбъект.КомпоновщикНастроек.Настройки.Отбор.Элементы;
    Если ЭтаФорма.Параметры.Свойство("Контрагент") Тогда
        Для каждого ЭлОтбора из ЭлементыОтбора Цикл
            Если ЭлОтбора.ЛевоеЗначение = Новый ПолеКомпоновкиДанных("Контрагент") Тогда
                 ЭлОтбора.ПравоеЗначение = ЭтаФорма.Параметры["Контрагент"];
                 ЭлОтбора.Использование = Истина;
                 Если ЗначениеЗаполнено(ЭлОтбора.ИдентификаторПользовательскойНастройки) Тогда
                    
                        ПользовательскийПараметр = ЭтотОбъект.Отчет.КомпоновщикНастроек.ПользовательскиеНастройки.Элементы.Найти(
                           ЭлОтбора.ИдентификаторПользовательскойНастройки);
                        Если ТипЗнч(ПользовательскийПараметр) = Тип("ЭлементОтбораКомпоновкиДанных") Тогда
                            ПользовательскийПараметр.ПравоеЗначение = ЭтаФорма.Параметры["Контрагент"];
                        КонецЕсли;                    
                   КонецЕсли;
            КонецЕсли;    
        КонецЦикла;    
    КонецЕсли;    

       В параметрах формы передаю значение которое сразу должно попасть в настройки, но этого не происходит.
       Управляемые формы.

(0) а зачем это всё? Просто вывести пользовательскую настройку на форму. Она для этого и придумана.

(1) Отчет открывается програмно из другой формы, на которой выбран Контрагент. Надо чтобы отчет открылся сразу с заполненной
настройкой.

Дядя Отладчик что говорит?

Конечно можно вот так:

ОткрытьФорму("Отчет.НашОтчет", ПараметрыФормы);
УсловияОтбора = Новый Структура;
ПараметрыФормы = Новый Структура("Отбор, СформироватьПриОткрытии", УсловияОтбора, Истина);
УсловияОтбора.Вставить("Контрагент", выбКонтрагент);

Но при (5) настройки с формы исчезают, хотя отбор и есть.

(3)  Отладчик говорит, что все хорошо.
     ЭлОтбора.ПравоеЗначение = тут контрагент ссылка
      ПользовательскийПараметр.ПравоеЗначение = тут тоже контрагент ссылка

Забыл сказать, код в (0) находитс я в форме отчета в ПриСозданииНаСервере(

+ (7) Но когда открывается форма, то ни в пользовательских настройках ни в настройках ничего нет.