Нормальный вопрос - можем же при приеме указать через территорию территориальные условия отличные от позиции ШР. Может сразу после приема человека, не меняя его позиции ШР, отправляют на аварийные работы в другую местность. Другое дело, что в типовой территориальные условия в СЗВ-ТД тянутся только из подразделения. Думаю это связано с тем, что под изменением (указанием) территории подразумеваете кратковременное изменение специфики работы:
https://its.1c.ru/db/staff1c#content:33620:zup30
"территории могут быть как постоянными для сотрудника, так и меняться с некоторой периодичностью (даже в пределах рабочего дня). От территории может зависеть, например, расчет страховых взносов (как дополнительных, так и основных), страховой стаж для отчетности в ПФР, права на отпуска, учет НДФЛ для уплаты в различные ИФНС, оплата труда: районный коэффициент, северная надбавка, надбавка за вредность и др. При использовании обособленных территорий появляется возможность описать территории, работу на которых требуется отличать с той или иной целью"..
Но тут получается, что для временного перевода мы можем отразить в СЗВ-ТД изменение условий работы в РКС / МКС, а через механизм территорий нет.