https://its.1c.ru/db/bsp315doc#content:4:1:issogl3_разработка_и_подключение_команд_создания_на_основании
Для внесения изменений в конфигурацию вовсе не обязательно снимать её с поддержки.
Достаточно просто включить возможность изменения.
Хотя, если речь идёт только о доработке обработок заполнения на основании, то лучше ограничиться использованием расширения.