Столкнулись с проблемой что при обмене УТ и БП в БП в документах поступлении и реализации не заполняется счет учета расчетов по авансам и так же способ учета авансов стоит "не зачитывать", хотя должен стоять "автоматически", а вот счет учета расчетов с контрагентами верно заполнен. Обмен по типовым правилам происходит. Регистр счета учета расчетов с контрагентами заполнен верно. Так и должно быть? Можно это как-то настроить?

Если это не пойми какого года выпуска и соответствия, т.е. не настроенный никак типовой обмен - то так и должно быть.

Потому что в УТ нет этих данных, которые нужно прописывать при записи документов ПТУ и РТУ в БП 3
Это все прописано в правилах конвертации.

А вот как устранить эту проблему : тут надо разбираться достаточно долго. Потому что вариантов много. Хотя для новичка это всего лишь "типовые правила обмена"

(0) Изучайте Совместное использование конфигураций "Управление торговлей" и "Бухгалтерия предприятия".
При выгрузке товарных, платежных документов из Управление торговлей в Бухгалтерия предприятия, в БП реквизит "Зачет аванса" или "Погашение задолженности" устанавливается равное:
"По документу"   - если заполнен документ расчетов.
"Не зачитывать"  - если не заполнен документ расчетов.
"Автоматически" - если в УТ договор не ведется по расчетным документам.
В каких случаях при выгрузке в БП реквизит Документ расчетов не заполняется там тоже описано.