могу ошибаться, но я всегда думал, что это включение внутренней таблицы для регистрации изменений конфигурации под выгрузку в планах РИБ обменов.
Возможно, что у конфы включено свойство "разрешить изменения с сохранением поддержки" и оно делает видимым это сообщение. А может я просто не всегда обращаю внимание есть это сообщение или нет.