Во время работы предприятия, каждые несколько секунд указатель мышки превращается в часы, как-будто срабатывает фоновое задание.
Это копия базы, там на уровне всей базы выключены регламентные. Обработка "регламентные и фоновые задания" показывает что последнее задание любого типа выполнялось месяц назад.
Как можно узнать что это стартует?

ЖР может показать

(0) Это обработка ожидания в которой идет вызов сервера. Какая именно - ищи сам.

Да, походу обработка ожидания стартует при открытии формы списка одного самописного документа.
В форме списка этого документа нет кода подключения обработки ожидания.
Там в принципе нет ни одного обработчика события, включая "ПриОткрытии" и "ПриОткрытииНаСервере". Хотя какая-то процедура в модуле формы списка есть, в отладчике туда не заходит.
Где еще может быть прописан вызов этого обработчика?

В ЖР пусто.

замер производительности не щупали?

(3) Установка обработка ожидания - это или метод формы или метод глобального контекста. В случае с формой обработчик находится в форме, в случае глобального контекста - в модуле приложения или глобальном общем модуле.

Замер производительности может показать, да.