Заполняем уточненный расчет 6 ндфл за 1 квартал 2021 в связи с перерасчетом НДФЛ с мат.выгоды.
В уточненке за 1 кв. 2021, ЗУП заполняет строку 110 раздела 2 "Сумма дохода начисленная физическим лицам". А должна ли?
А вот в уточненке за 2021, ЗУП НЕ заполняет эту строку 110 раздела 2. А должно ли?

Оно заполняет или не заполняет не от того, что там искусственный интеллект решения принимиает, а оттого, что в регистре для учета по НДФЛ есть поле такое.
В самом конце таблички регистров, в которых записи деляются при проведении документов с начислениями.

Ну и соотв. может быть, что для уточненки за 1 кв использована одна форма отчета, а для уточненки за год целиков - другая.
Просто перепутали где какую форму использовать. Или где какая обработка вызывается. При условии, что данных в базе хватает и они одинаковые и за 1 кв и за год.