В общем, обратились пользователи, что принтер этикеток фигово печатает именно штрихкод из 1С.
Пользователю работают по РДП, в связи с чем проверили печать сначала с самого компьютера, потом с файла на сервере. Каждый раз нормально сканирует.
Из 1С начинается какая-то пляска, половина полосок получается "точками", особенно тонкие линии. В итоге сканер не считывает такой штрихкод и ценность этикеток около нуля

(0) тут топиков было огромное количество на эту тему. Рекомендую поискать. Чаще всего проблема в том что пытаются печатать ШК слишком маленького размера, наплевав на то, что разрешение у этикеточника очень низкое (всего 200 точек на дюйм, в отличие, например, от лазерного принтера - 600-1200 точек на дюйм).

самый лучший выход из положения - печать ШК средствами принтера (используя язык описания этикеток). При наличии исправной головки без битых пикселей это даст гарантированно читаемый код.

Причина нечеткой печати как правило заключается в том, что драйверу принтера передается не вектор, а растр. С параметрами драйвера принтера на рдп-сервере играйтесь или модуля формирования печатной формы штрихкода. Возможно, решить проблему сможет повышение разрешения печати.