(2) При первичном обмене или на постоянной основе? Если первично то они вроде и так выгрузятся, а если постоянно то подход неверен, источником НСИ должна быть УТ
(6) она и будет выдывать ошибку, так как состав полей разный. Использование этой обработки предполагает идентичные источник и приемник. первое что приходит в голову - выгрузить правила обмена БП-УТ, запихать в кд2, выключить все кроме справочников, обменяться обработкой "Универсальный обмен данными в формате XML"
TurboConf — расширение возможностей Конфигуратора 1С